Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATE1O95260 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATE1O95260 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATE1O95260 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATE1O95260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATE1O95260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATE1O95260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATE1O95260 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATE1O95260 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATE1O95260 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATE1O95260 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms