Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDRT1O95170 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDRT1O95170 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDRT1O95170 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDRT1O95170 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDRT1O95170 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms