Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIB2O75838 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIB2O75838 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIB2O75838 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIB2O75838 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIB2O75838 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIB2O75838 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIB2O75838 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIB2O75838 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIB2O75838 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIB2O75838 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIB2O75838 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB2O75838 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB2O75838 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB2O75838 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB2O75838 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB2O75838 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB2O75838 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CIB2O75838 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CIB2O75838 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CIB2O75838 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CIB2O75838 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CIB2O75838 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CIB2O75838 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIB2O75838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIB2O75838 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIB2O75838 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIB2O75838 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIB2O75838 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIB2O75838 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIB2O75838 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIB2O75838 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIB2O75838 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIB2O75838 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIB2O75838 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIB2O75838 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB2O75838 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB2O75838 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIB2O75838 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIB2O75838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIB2O75838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB2O75838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB2O75838 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIB2O75838 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB2O75838 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB2O75838 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB2O75838 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB2O75838 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB2O75838 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB2O75838 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIB2O75838 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CIB2O75838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIB2O75838 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB2O75838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB2O75838 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB2O75838 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB2O75838 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB2O75838 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB2O75838 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB2O75838 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB2O75838 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB2O75838 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB2O75838 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB2O75838 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB2O75838 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB2O75838 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB2O75838 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB2O75838 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB2O75838 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB2O75838 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB2O75838 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB2O75838 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB2O75838 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB2O75838 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB2O75838 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms