Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC22O60826 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC22O60826 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC22O60826 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC22O60826 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms