Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGR3O43761 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR3O43761 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR3O43761 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms