Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCP110O43303 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCP110O43303 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCP110O43303 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCP110O43303 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCP110O43303 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCP110O43303 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCP110O43303 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCP110O43303 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCP110O43303 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCP110O43303 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCP110O43303 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCP110O43303 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCP110O43303 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCP110O43303 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCP110O43303 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCP110O43303 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCP110O43303 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCP110O43303 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCP110O43303 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCP110O43303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCP110O43303 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCP110O43303 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCP110O43303 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCP110O43303 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCP110O43303 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCP110O43303 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCP110O43303 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCP110O43303 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCP110O43303 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCP110O43303 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCP110O43303 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCP110O43303 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCP110O43303 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCP110O43303 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCP110O43303 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCP110O43303 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCP110O43303 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCP110O43303 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCP110O43303 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCP110O43303 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCP110O43303 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCP110O43303 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCP110O43303 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCP110O43303 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCP110O43303 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCP110O43303 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCP110O43303 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCP110O43303 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCP110O43303 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCP110O43303 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCP110O43303 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCP110O43303 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCP110O43303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCP110O43303 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCP110O43303 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCP110O43303 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCP110O43303 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCP110O43303 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCP110O43303 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCP110O43303 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCP110O43303 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCP110O43303 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCP110O43303 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCP110O43303 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCP110O43303 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCP110O43303 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCP110O43303 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms