Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP3O15049 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP3O15049 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP3O15049 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms