Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16AO15027 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16AO15027 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16AO15027 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC16AO15027 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms