Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PODXLO00592 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PODXLO00592 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PODXLO00592 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PODXLO00592 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PODXLO00592 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PODXLO00592 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PODXLO00592 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PODXLO00592 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PODXLO00592 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PODXLO00592 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PODXLO00592 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PODXLO00592 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PODXLO00592 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PODXLO00592 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PODXLO00592 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PODXLO00592 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PODXLO00592 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PODXLO00592 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PODXLO00592 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PODXLO00592 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXLO00592 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXLO00592 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXLO00592 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXLO00592 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXLO00592 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXLO00592 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXLO00592 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXLO00592 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXLO00592 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXLO00592 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXLO00592 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXLO00592 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXLO00592 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXLO00592 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXLO00592 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXLO00592 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXLO00592 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXLO00592 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXLO00592 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXLO00592 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXLO00592 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXLO00592 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXLO00592 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXLO00592 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXLO00592 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXLO00592 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXLO00592 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXLO00592 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXLO00592 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXLO00592 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXLO00592 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXLO00592 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXLO00592 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXLO00592 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PODXLO00592 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PODXLO00592 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PODXLO00592 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PODXLO00592 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PODXLO00592 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PODXLO00592 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PODXLO00592 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PODXLO00592 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PODXLO00592 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PODXLO00592 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PODXLO00592 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PODXLO00592 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PODXLO00592 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PODXLO00592 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms