Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TK2O00142 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TK2O00142 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TK2O00142 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TK2O00142 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TK2O00142 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TK2O00142 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TK2O00142 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TK2O00142 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TK2O00142 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TK2O00142 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TK2O00142 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TK2O00142 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TK2O00142 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TK2O00142 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TK2O00142 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TK2O00142 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TK2O00142 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TK2O00142 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TK2O00142 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TK2O00142 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TK2O00142 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TK2O00142 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TK2O00142 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TK2O00142 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TK2O00142 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TK2O00142 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TK2O00142 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TK2O00142 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TK2O00142 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TK2O00142 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TK2O00142 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TK2O00142 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TK2O00142 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TK2O00142 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TK2O00142 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TK2O00142 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TK2O00142 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TK2O00142 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TK2O00142 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TK2O00142 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TK2O00142 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TK2O00142 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TK2O00142 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TK2O00142 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TK2O00142 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TK2O00142 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TK2O00142 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TK2O00142 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TK2O00142 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TK2O00142 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TK2O00142 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TK2O00142 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TK2O00142 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TK2O00142 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TK2O00142 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TK2O00142 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TK2O00142 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TK2O00142 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TK2O00142 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TK2O00142 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TK2O00142 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TK2O00142 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TK2O00142 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TK2O00142 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TK2O00142 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TK2O00142 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TK2O00142 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TK2O00142 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TK2O00142 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TK2O00142 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TK2O00142 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TK2O00142 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TK2O00142 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TK2O00142 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms