Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms