Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYSRT1A8MQ03 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYSRT1A8MQ03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYSRT1A8MQ03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYSRT1A8MQ03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYSRT1A8MQ03 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms