Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRR3A8MPY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR3A8MPY1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR3A8MPY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR3A8MPY1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms