Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNC1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNC1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNC1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNC1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNC1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNC1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNC1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNC1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNC1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNC1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNC1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A6NNC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNC1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNC1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNC1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNC1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NNC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNC1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNC1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NNC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNC1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NNC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NNC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNC1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NNC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NNC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNC1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms