Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSAPA4D1B5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSAPA4D1B5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSAPA4D1B5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSAPA4D1B5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms