Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC2BA2VCK2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCDC2BA2VCK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCDC2BA2VCK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCDC2BA2VCK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCDC2BA2VCK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCDC2BA2VCK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms