Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms