RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.38■■■■■ 5.66
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C4orf48-201ENST00000409248 ABCC9O60706 1549 aa43.78■■■■■ 4.6
C4orf48-201ENST00000409248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
C4orf48-201ENST00000409248 NACADO15069 1562 aa42.17■■■■■ 4.34
C4orf48-201ENST00000409248 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.95■■■■■ 4.31
C4orf48-201ENST00000409248 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.92■■■■■ 4.3
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.74■■■■■ 4.27
C4orf48-201ENST00000409248 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.25■■■■■ 4.19
C4orf48-201ENST00000409248 SCRIBQ14160 1630 aa40.9■■■■■ 4.14
C4orf48-201ENST00000409248 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.86■■■■■ 4.13
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C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.01■■■■■ 4
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C4orf48-201ENST00000409248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.65■■■■□ 3.94
C4orf48-201ENST00000409248 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.37■■■■□ 3.89
C4orf48-201ENST00000409248 SMARCA4P51532 1647 aa39.14■■■■□ 3.86
C4orf48-201ENST00000409248 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
C4orf48-201ENST00000409248 SMARCA2P51531 1590 aa38.9■■■■□ 3.82
C4orf48-201ENST00000409248 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
C4orf48-201ENST00000409248 NCAPD3P42695 1498 aa38.84■■■■□ 3.81
C4orf48-201ENST00000409248 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.79■■■■□ 3.8
C4orf48-201ENST00000409248 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.75■■■■□ 3.79
C4orf48-201ENST00000409248 HMGXB3Q12766 1538 aa38.73■■■■□ 3.79
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C4orf48-201ENST00000409248 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
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C4orf48-201ENST00000409248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.89■■■■□ 3.66
C4orf48-201ENST00000409248 NESP48681 1621 aa37.87■■■■□ 3.65
C4orf48-201ENST00000409248 ERCC6Q03468 1493 aa37.8■■■■□ 3.64
C4orf48-201ENST00000409248 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.69■■■■□ 3.62
C4orf48-201ENST00000409248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.59■■■■□ 3.61
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
C4orf48-201ENST00000409248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.51■■■■□ 3.6
C4orf48-201ENST00000409248 CFTRP13569 1480 aa37.5■■■■□ 3.59
C4orf48-201ENST00000409248 CUX2O14529 1486 aa37.41■■■■□ 3.58
C4orf48-201ENST00000409248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
C4orf48-201ENST00000409248 PRDM2Q13029 1718 aa37.36■■■■□ 3.57
C4orf48-201ENST00000409248 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
C4orf48-201ENST00000409248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.3■■■■□ 3.56
C4orf48-201ENST00000409248 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.29■■■■□ 3.56
C4orf48-201ENST00000409248 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.22■■■■□ 3.55
C4orf48-201ENST00000409248 WDR62O43379 1518 aa37.11■■■■□ 3.53
C4orf48-201ENST00000409248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
C4orf48-201ENST00000409248 ABCC8Q09428 1581 aa36.74■■■■□ 3.47
C4orf48-201ENST00000409248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.71■■■■□ 3.47
C4orf48-201ENST00000409248 TOPBP1Q92547 1522 aa36.7■■■■□ 3.47
C4orf48-201ENST00000409248 IFT140Q96RY7 1462 aa36.49■■■■□ 3.43
C4orf48-201ENST00000409248 CUX1P39880 1505 aa36.42■■■■□ 3.42
C4orf48-201ENST00000409248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
C4orf48-201ENST00000409248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
C4orf48-201ENST00000409248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.31■■■■□ 3.4
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
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C4orf48-201ENST00000409248 SOGA1O94964 1423 aa36.2■■■■□ 3.39
C4orf48-201ENST00000409248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
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C4orf48-201ENST00000409248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.17■■■■□ 3.38
C4orf48-201ENST00000409248 TOP2BQ02880 1626 aa36.16■■■■□ 3.38
C4orf48-201ENST00000409248 WDR97A6NE52 1622 aa36.13■■■■□ 3.37
C4orf48-201ENST00000409248 SYNJ1O43426 1573 aa36.12■■■■□ 3.37
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.11■■■■□ 3.37
C4orf48-201ENST00000409248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.361e-7■■□□□ 13.1
C4orf48-201ENST00000409248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.97■■■■□ 3.35
C4orf48-201ENST00000409248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
C4orf48-201ENST00000409248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.86■■■■□ 3.33
C4orf48-201ENST00000409248 GRIN2BQ13224 1484 aa35.83■■■■□ 3.33
C4orf48-201ENST00000409248 PBRM1Q86U86 1689 aa35.83■■■■□ 3.33
C4orf48-201ENST00000409248 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.82■■■■□ 3.32
C4orf48-201ENST00000409248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.78■■■■□ 3.32
C4orf48-201ENST00000409248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
C4orf48-201ENST00000409248 CHD1O14646 1710 aa35.76■■■■□ 3.31
C4orf48-201ENST00000409248 OSCARQ8IYS5 282 aa35.75■■■■□ 3.31
C4orf48-201ENST00000409248 SYNJ2O15056 1496 aa35.6■■■■□ 3.29
C4orf48-201ENST00000409248 FBLN2P98095 1184 aa35.59■■■■□ 3.29
C4orf48-201ENST00000409248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.57■■■■□ 3.28
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTS12P58397 1594 aa35.53■■■■□ 3.28
C4orf48-201ENST00000409248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
C4orf48-201ENST00000409248 KIF27Q86VH2 1401 aa35.46■■■■□ 3.27
C4orf48-201ENST00000409248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.41■■■■□ 3.26
C4orf48-201ENST00000409248 GRIN2AQ12879 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
C4orf48-201ENST00000409248 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.35■■■■□ 3.25
C4orf48-201ENST00000409248 CUL7Q14999 1698 aa35.3■■■■□ 3.24
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM41Q8WV44 630 aa35.28■■■■□ 3.24
C4orf48-201ENST00000409248 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
C4orf48-201ENST00000409248 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
C4orf48-201ENST00000409248 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGEF11O15085 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
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C4orf48-201ENST00000409248 NUP160Q12769 1436 aa35.2■■■■□ 3.23
C4orf48-201ENST00000409248 CEP170Q5SW79 1584 aa35.19■■■■□ 3.22
C4orf48-201ENST00000409248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.04■■■■□ 3.2
C4orf48-201ENST00000409248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.02■■■■□ 3.2
C4orf48-201ENST00000409248 SHROOM2Q13796 1616 aa34.98■■■■□ 3.19
C4orf48-201ENST00000409248 ARAP1Q96P48 1450 aa34.96■■■■□ 3.19
C4orf48-201ENST00000409248 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.89■■■■□ 3.18
C4orf48-201ENST00000409248 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.89■■■■□ 3.18
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