Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS1P54277 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS1P54277 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS1P54277 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS1P54277 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms