RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234347.9

PRTN3-201, Transcript of proteinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRTN3, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3-201ENST00000234347 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.02■■■■■ 5.44
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.44■■■■■ 4.54
PRTN3-201ENST00000234347 ABCC9O60706 1549 aa42.25■■■■■ 4.35
PRTN3-201ENST00000234347 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
PRTN3-201ENST00000234347 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.76■■■■■ 4.12
PRTN3-201ENST00000234347 NACADO15069 1562 aa40.74■■■■■ 4.11
PRTN3-201ENST00000234347 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.72■■■■■ 4.11
PRTN3-201ENST00000234347 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.57■■■■■ 4.09
PRTN3-201ENST00000234347 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.54■■■■■ 4.08
PRTN3-201ENST00000234347 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.89■■■■□ 3.98
PRTN3-201ENST00000234347 SCRIBQ14160 1630 aa39.73■■■■□ 3.95
PRTN3-201ENST00000234347 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.56■■■■□ 3.92
PRTN3-201ENST00000234347 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.52■■■■□ 3.92
PRTN3-201ENST00000234347 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.05■■■■□ 3.84
PRTN3-201ENST00000234347 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.51■■■■□ 3.76
PRTN3-201ENST00000234347 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
PRTN3-201ENST00000234347 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.23■■■■□ 3.71
PRTN3-201ENST00000234347 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.21■■■■□ 3.71
PRTN3-201ENST00000234347 SMARCA4P51532 1647 aa38■■■■□ 3.67
PRTN3-201ENST00000234347 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
PRTN3-201ENST00000234347 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.83■■■■□ 3.65
PRTN3-201ENST00000234347 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.7■■■■□ 3.63
PRTN3-201ENST00000234347 SMARCA2P51531 1590 aa37.63■■■■□ 3.61
PRTN3-201ENST00000234347 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.59■■■■□ 3.61
PRTN3-201ENST00000234347 NCAPD3P42695 1498 aa37.58■■■■□ 3.61
PRTN3-201ENST00000234347 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
PRTN3-201ENST00000234347 HMGXB3Q12766 1538 aa37.46■■■■□ 3.59
PRTN3-201ENST00000234347 WIZO95785 1651 aa37.44■■■■□ 3.58
PRTN3-201ENST00000234347 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PRTN3-201ENST00000234347 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PRTN3-201ENST00000234347 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PRTN3-201ENST00000234347 NESP48681 1621 aa36.68■■■■□ 3.46
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.59■■■■□ 3.45
PRTN3-201ENST00000234347 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.56■■■■□ 3.44
PRTN3-201ENST00000234347 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.51■■■■□ 3.43
PRTN3-201ENST00000234347 CFTRP13569 1480 aa36.38■■■■□ 3.41
PRTN3-201ENST00000234347 ERCC6Q03468 1493 aa36.34■■■■□ 3.41
PRTN3-201ENST00000234347 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.26■■■■□ 3.4
PRTN3-201ENST00000234347 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.26■■■■□ 3.39
PRTN3-201ENST00000234347 PRDM2Q13029 1718 aa36.15■■■■□ 3.38
PRTN3-201ENST00000234347 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.12■■■■□ 3.37
PRTN3-201ENST00000234347 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PRTN3-201ENST00000234347 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.04■■■■□ 3.36
PRTN3-201ENST00000234347 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.93■■■■□ 3.34
PRTN3-201ENST00000234347 CUX2O14529 1486 aa35.83■■■■□ 3.33
PRTN3-201ENST00000234347 WDR62O43379 1518 aa35.83■■■■□ 3.33
PRTN3-201ENST00000234347 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
PRTN3-201ENST00000234347 TOPBP1Q92547 1522 aa35.59■■■■□ 3.29
PRTN3-201ENST00000234347 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.58■■■■□ 3.29
PRTN3-201ENST00000234347 ABCC8Q09428 1581 aa35.51■■■■□ 3.27
PRTN3-201ENST00000234347 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
PRTN3-201ENST00000234347 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PRTN3-201ENST00000234347 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
PRTN3-201ENST00000234347 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.29■■■■□ 3.24
PRTN3-201ENST00000234347 SYNJ1O43426 1573 aa35.28■■■■□ 3.24
PRTN3-201ENST00000234347 IFT140Q96RY7 1462 aa35.26■■■■□ 3.23
PRTN3-201ENST00000234347 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.22■■■■□ 3.23
PRTN3-201ENST00000234347 TOP2BQ02880 1626 aa35.21■■■■□ 3.23
PRTN3-201ENST00000234347 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
PRTN3-201ENST00000234347 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.18■■■■□ 3.22
PRTN3-201ENST00000234347 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
PRTN3-201ENST00000234347 SOGA1O94964 1423 aa35.13■■■■□ 3.21
PRTN3-201ENST00000234347 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PRTN3-201ENST00000234347 WDR97A6NE52 1622 aa35.02■■■■□ 3.2
PRTN3-201ENST00000234347 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
PRTN3-201ENST00000234347 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.93■■■■□ 3.18
PRTN3-201ENST00000234347 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PRTN3-201ENST00000234347 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.81■■■■□ 3.16
PRTN3-201ENST00000234347 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.75■■■■□ 3.15
PRTN3-201ENST00000234347 PBRM1Q86U86 1689 aa34.71■■■■□ 3.15
PRTN3-201ENST00000234347 GRIN2BQ13224 1484 aa34.69■■■■□ 3.14
PRTN3-201ENST00000234347 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.65■■■■□ 3.14
PRTN3-201ENST00000234347 TRIM41Q8WV44 630 aa34.62■■■■□ 3.13
PRTN3-201ENST00000234347 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
PRTN3-201ENST00000234347 CHD1O14646 1710 aa34.52■■■■□ 3.12
PRTN3-201ENST00000234347 KIF27Q86VH2 1401 aa34.51■■■■□ 3.12
PRTN3-201ENST00000234347 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
PRTN3-201ENST00000234347 ADAMTS12P58397 1594 aa34.46■■■■□ 3.11
PRTN3-201ENST00000234347 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.45■■■■□ 3.11
PRTN3-201ENST00000234347 SYNJ2O15056 1496 aa34.44■■■■□ 3.1
PRTN3-201ENST00000234347 FBLN2P98095 1184 aa34.41■■■■□ 3.1
PRTN3-201ENST00000234347 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.4■■■■□ 3.1
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PRTN3-201ENST00000234347 IGF1RP08069 1367 aa34.35■■■■□ 3.09
PRTN3-201ENST00000234347 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.34■■■■□ 3.09
PRTN3-201ENST00000234347 OSCARQ8IYS5 282 aa34.34■■■■□ 3.09
PRTN3-201ENST00000234347 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
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PRTN3-201ENST00000234347 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.14■■■■□ 3.06
PRTN3-201ENST00000234347 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.14■■■■□ 3.06
PRTN3-201ENST00000234347 CEP170Q5SW79 1584 aa34.14■■■■□ 3.06
PRTN3-201ENST00000234347 NUP160Q12769 1436 aa34.11■■■■□ 3.05
PRTN3-201ENST00000234347 EEA1Q15075 1411 aa34.02■■■■□ 3.04
PRTN3-201ENST00000234347 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.98■■■■□ 3.03
PRTN3-201ENST00000234347 PRXQ9BXM0 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
PRTN3-201ENST00000234347 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PRTN3-201ENST00000234347 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.93■■■■□ 3.02
PRTN3-201ENST00000234347 ARHGEF11O15085 1522 aa33.9■■■■□ 3.02
PRTN3-201ENST00000234347 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.89■■■■□ 3.02
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