Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms