Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms