RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.99■■■■■ 4.15
USP21-201ENST00000289865 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.14■■■■□ 3.22
USP21-201ENST00000289865 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
USP21-201ENST00000289865 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
USP21-201ENST00000289865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.88■■■■□ 3.01
USP21-201ENST00000289865 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.71■■■□□ 2.99
USP21-201ENST00000289865 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
USP21-201ENST00000289865 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.89■■■□□ 2.86
USP21-201ENST00000289865 SCRIBQ14160 1630 aa32.74■■■□□ 2.83
USP21-201ENST00000289865 ABCC9O60706 1549 aa32.66■■■□□ 2.82
USP21-201ENST00000289865 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.63■■■□□ 2.81
USP21-201ENST00000289865 NACADO15069 1562 aa32.52■■■□□ 2.8
USP21-201ENST00000289865 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
USP21-201ENST00000289865 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.05■■■□□ 2.72
USP21-201ENST00000289865 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.92■■■□□ 2.7
USP21-201ENST00000289865 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
USP21-201ENST00000289865 WIZO95785 1651 aa31.65■■■□□ 2.66
USP21-201ENST00000289865 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.59■■■□□ 2.65
USP21-201ENST00000289865 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.58■■■□□ 2.65
USP21-201ENST00000289865 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
USP21-201ENST00000289865 TRIM41Q8WV44 630 aa31.45■■■□□ 2.63
USP21-201ENST00000289865 SMARCA4P51532 1647 aa31.32■■■□□ 2.6
USP21-201ENST00000289865 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
USP21-201ENST00000289865 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.19■■■□□ 2.58
USP21-201ENST00000289865 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.15■■■□□ 2.58
USP21-201ENST00000289865 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
USP21-201ENST00000289865 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
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USP21-201ENST00000289865 HRCP23327 699 aa31■■■□□ 2.55
USP21-201ENST00000289865 SMARCA2P51531 1590 aa30.99■■■□□ 2.55
USP21-201ENST00000289865 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.99■■■□□ 2.55
USP21-201ENST00000289865 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.79■■■□□ 2.52
USP21-201ENST00000289865 ABCC8Q09428 1581 aa30.77■■■□□ 2.52
USP21-201ENST00000289865 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.77■■■□□ 2.52
USP21-201ENST00000289865 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
USP21-201ENST00000289865 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.56■■■□□ 2.48
USP21-201ENST00000289865 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
USP21-201ENST00000289865 SOGA1O94964 1423 aa30.38■■■□□ 2.45
USP21-201ENST00000289865 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
USP21-201ENST00000289865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
USP21-201ENST00000289865 EEA1Q15075 1411 aa30.28■■■□□ 2.44
USP21-201ENST00000289865 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.24■■■□□ 2.43
USP21-201ENST00000289865 SYNJ1O43426 1573 aa30.21■■■□□ 2.43
USP21-201ENST00000289865 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.18■■■□□ 2.42
USP21-201ENST00000289865 CEP162Q5TB80 1403 aa30.12■■■□□ 2.41
USP21-201ENST00000289865 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.11■■■□□ 2.41
USP21-201ENST00000289865 HMGXB3Q12766 1538 aa30.06■■■□□ 2.4
USP21-201ENST00000289865 NCAPD3P42695 1498 aa30.04■■■□□ 2.4
USP21-201ENST00000289865 GOLGA3Q08378 1498 aa30.03■■■□□ 2.4
USP21-201ENST00000289865 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
USP21-201ENST00000289865 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
USP21-201ENST00000289865 KIF21BO75037 1637 aa29.91■■■□□ 2.38
USP21-201ENST00000289865 TOP2BQ02880 1626 aa29.91■■■□□ 2.38
USP21-201ENST00000289865 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.9■■■□□ 2.38
USP21-201ENST00000289865 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.84■■■□□ 2.37
USP21-201ENST00000289865 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
USP21-201ENST00000289865 CFTRP13569 1480 aa29.7■■■□□ 2.34
USP21-201ENST00000289865 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.69■■■□□ 2.34
USP21-201ENST00000289865 CUX1P39880 1505 aa29.66■■■□□ 2.34
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USP21-201ENST00000289865 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.48■■■□□ 2.31
USP21-201ENST00000289865 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.48■■■□□ 2.31
USP21-201ENST00000289865 PRXQ9BXM0 1461 aa29.48■■■□□ 2.31
USP21-201ENST00000289865 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
USP21-201ENST00000289865 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.48■■■□□ 2.31
USP21-201ENST00000289865 KIF27Q86VH2 1401 aa29.43■■■□□ 2.3
USP21-201ENST00000289865 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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USP21-201ENST00000289865 ARAP1Q96P48 1450 aa29.22■■■□□ 2.27
USP21-201ENST00000289865 CUX2O14529 1486 aa29.21■■■□□ 2.27
USP21-201ENST00000289865 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.18■■■□□ 2.26
USP21-201ENST00000289865 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.14■■■□□ 2.26
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USP21-201ENST00000289865 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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USP21-201ENST00000289865 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29■■■□□ 2.23
USP21-201ENST00000289865 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.99■■■□□ 2.23
USP21-201ENST00000289865 TOPBP1Q92547 1522 aa28.93■■■□□ 2.22
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USP21-201ENST00000289865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.89■■■□□ 2.22
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USP21-201ENST00000289865 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.86■■■□□ 2.21
USP21-201ENST00000289865 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.85■■■□□ 2.21
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USP21-201ENST00000289865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
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USP21-201ENST00000289865 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
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USP21-201ENST00000289865 TIAM1Q13009 1591 aa28.68■■■□□ 2.18
USP21-201ENST00000289865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.66■■■□□ 2.18
USP21-201ENST00000289865 MAP3K1Q13233 1512 aa28.65■■■□□ 2.18
USP21-201ENST00000289865 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.64■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.62■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.61■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.59■■■□□ 2.17
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