RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.2■■■■■ 5.15
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TMCO3-201ENST00000375391 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.43■■■■□ 3.74
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TMCO3-201ENST00000375391 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.96■■■■□ 3.35
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.9■■■■□ 3.34
TMCO3-201ENST00000375391 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.87■■■■□ 3.33
TMCO3-201ENST00000375391 SMARCA2P51531 1590 aa35.82■■■■□ 3.32
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TMCO3-201ENST00000375391 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.45■■■■□ 3.11
TMCO3-201ENST00000375391 PRDM2Q13029 1718 aa34.39■■■■□ 3.1
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TMCO3-201ENST00000375391 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.08
TMCO3-201ENST00000375391 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.29■■■■□ 3.08
TMCO3-201ENST00000375391 SYNJ1O43426 1573 aa34.24■■■■□ 3.07
TMCO3-201ENST00000375391 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.24■■■■□ 3.07
TMCO3-201ENST00000375391 CUX1P39880 1505 aa34.19■■■■□ 3.06
TMCO3-201ENST00000375391 ERCC6Q03468 1493 aa34.15■■■■□ 3.06
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TMCO3-201ENST00000375391 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.51■■■□□ 2.95
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TMCO3-201ENST00000375391 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
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TMCO3-201ENST00000375391 GRIN2AQ12879 1464 aa32.7■■■□□ 2.83
TMCO3-201ENST00000375391 CEP162Q5TB80 1403 aa32.62■■■□□ 2.81
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