Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 BUB1YGR188C 3066 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 CFT2YLR115W 2580 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 VPS8YAL002W 3825 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 MVP1YMR004W 1536 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 YGR250CYGR250C 2346 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 TRL1YJL087C 2484 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 MUK1YPL070W 1839 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SMC6YLR383W 3345 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 MNE1YOR350C 1992 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 BLI1YKL061W 342 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SAP185YJL098W 3177 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 IRC8YJL051W 2469 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SCW11YGL028C 1629 nt2.31□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 HCS1YKL017C 2052 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 UBP15YMR304W 3693 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 MDM20YOL076W 2391 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 VTC3YPL019C 2508 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 snR60snR60 104 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 CDC36YDL165W 576 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 TFC3YAL001C 3483 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 INP2YMR163C 2118 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SSQ1YLR369W 1974 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 NUP170YBL079W 4509 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 ABF2YMR072W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 YNL337WYNL337W 255 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 COS111YBR203W 2775 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 STH1YIL126W 4080 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SWI5YDR146C 2130 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 YBR064WYBR064W 429 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 PLC1YPL268W 2610 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 RFX1YLR176C 2436 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 HSL1YKL101W 4557 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 CDC60YPL160W 3273 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 LCD1YDR499W 2244 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YGL041CYGL041C 204 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 PAU18YLL064C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 CYB5YNL111C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 PAU6YNR076W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YLL032CYLL032C 2478 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 LYS14YDR034C 2373 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 SLY1YDR189W 2001 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 BRE1YDL074C 2103 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 BPH1YCR032W 6504 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 EMP24YGL200C 612 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 SAP190YKR028W 3102 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 SPP41YDR464W 4308 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 RTT101YJL047C 2529 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 SCP160YJL080C 3669 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YNL028WYNL028W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 RPB10YOR210W 213 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YDR341CYDR341C 1824 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 PET309YLR067C 2898 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 SSS1YDR086C 243 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YJL135WYJL135W 318 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YOR225WYOR225W 330 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 YCL046WYCL046W 324 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS3Q08438 snR55snR55 98 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 RTT107YHR154W 3213 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 FKS1YLR342W 5631 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 CSE2YNR010W 450 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 ZRG17YNR039C 1818 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 snR72snR72 98 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 RPL37BYDR500C 267 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 VIK1YPL253C 1944 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 UTP22YGR090W 3714 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 NAM7YMR080C 2916 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 TFC8YPL007C 1767 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 NIP100YPL174C 2607 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YPR097WYPR097W 3222 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 APQ12YIL040W 417 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 APL5YPL195W 2799 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 SPT21YMR179W 2277 nt2.19□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 ATG11YPR049C 3537 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 BRP1YGL007W 378 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YGL052WYGL052W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 DGR1YNL130C-A 147 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 UFD4YKL010C 4452 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 SYH1YPL105C 2550 nt2.18□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 RGA1YOR127W 3024 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 NPR2YEL062W 1848 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 INA22YIR024C 651 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YOR015WYOR015W 360 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 MPT5YGL178W 2580 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 GCN2YDR283C 4980 nt2.17□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 HER1YOR227W 3741 nt2.16□□□□□ -2.06
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