RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SPT21	YMR179W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SPT21	YMR179W	FAP1	P53971	965 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SPT21	YMR179W	PRY3	P47033	881 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SPT21	YMR179W	PRI1	P10363	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SPT21	YMR179W	AAD16	Q02895	342 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPT21	YMR179W	ISW2	Q08773	1120 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SPT21	YMR179W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
SPT21	YMR179W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
SPT21	YMR179W	YCK3	P39962	524 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPT21	YMR179W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SPT21	YMR179W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SPT21	YMR179W	AVT3	P36062	692 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SPT21	YMR179W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SPT21	YMR179W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SPT21	YMR179W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SPT21	YMR179W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SPT21	YMR179W	MRPL32	P25348	183 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SPT21	YMR179W	REB1	P21538	810 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SPT21	YMR179W	SPT21	P35209	758 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SPT21	YMR179W	YGL015C	P33199	130 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SPT21	YMR179W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SPT21	YMR179W	CDC27	P38042	758 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPT21	YMR179W	TFC8	Q12308	588 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPT21	YMR179W	RIM101	P33400	625 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPT21	YMR179W	HO	P09932	586 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SPT21	YMR179W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPT21	YMR179W	DCD1	P06773	312 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPT21	YMR179W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SPT21	YMR179W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SPT21	YMR179W	BCH2	P36122	765 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SPT21	YMR179W	SCY1	P53009	804 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SPT21	YMR179W	OXP1	P28273	1286 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SPT21	YMR179W	TFA1	P36100	482 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SPT21	YMR179W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SPT21	YMR179W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SPT21	YMR179W	TGL3	P40308	642 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SPT21	YMR179W	PTP3	P40048	928 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SPT21	YMR179W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
SPT21	YMR179W	EPS1	P40557	701 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SPT21	YMR179W	BDF1	P35817	686 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SPT21	YMR179W	RSM7	P47150	247 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SPT21	YMR179W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPT21	YMR179W	AI2	P03876	854 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	BBC1	P47068	1157 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	YLR271W	Q06152	274 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	MST1	P07236	462 aa		5.15	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	UBP9	P39967	754 aa		5.15	□□□□□ -1.58
SPT21	YMR179W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.13	□□□□□ -1.59	not detected
SPT21	YMR179W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SPT21	YMR179W	SSP1	P38871	571 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPT21	YMR179W	YOR238W	Q08634	303 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPT21	YMR179W	YAP5	P40574	245 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPT21	YMR179W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
SPT21	YMR179W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPT21	YMR179W	MRM1	P25270	412 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPT21	YMR179W	CST9	Q06032	482 aa		5	□□□□□ -1.61
SPT21	YMR179W	MGA2	P40578	1113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPT21	YMR179W	VNX1	P42839	908 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPT21	YMR179W	VPS29	P38759	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	WSC3	Q12215	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	PIB1	Q06651	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	SPP1	Q03012	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	RTG3	P38165	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	GTT3	P39996	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT21	YMR179W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
SPT21	YMR179W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	RCR1	P38212	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	STS1	P38637	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	YFR006W	P43590	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	IOC2	Q12072	812 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	MSB4	Q12317	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT21	YMR179W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	FKH1	P40466	484 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	ULI1	P43604	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	SAM3	Q08986	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	LDB19	Q12502	818 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	SET4	P42948	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPT21	YMR179W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	RAM2	P29703	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	YJL171C	P46992	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	RTG1	P32607	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	GYP5	Q12344	894 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT21	YMR179W	SEC61	P32915	480 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	DAN4	P47179	1161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	BMT6	Q12291	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	EDS1	P38073	919 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	HTA2	P04912	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	DCW1	P36091	449 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT21	YMR179W	JIP4	Q03361	876 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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