RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	FAP1	P53971	965 aa		10.98	□□□□□ -0.65
YJL135W	YJL135W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
YJL135W	YJL135W	PRY3	P47033	881 aa		10.34	□□□□□ -0.75
YJL135W	YJL135W	AAD16	Q02895	342 aa		9.89	□□□□□ -0.83
YJL135W	YJL135W	PRI1	P10363	409 aa		9.8	□□□□□ -0.84
YJL135W	YJL135W	YCK3	P39962	524 aa		9.73	□□□□□ -0.85
YJL135W	YJL135W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
YJL135W	YJL135W	ISW2	Q08773	1120 aa		9.34	□□□□□ -0.91
YJL135W	YJL135W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
YJL135W	YJL135W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
YJL135W	YJL135W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
YJL135W	YJL135W	MRPL32	P25348	183 aa		8.88	□□□□□ -0.99
YJL135W	YJL135W	YGL015C	P33199	130 aa		8.81	□□□□□ -1
YJL135W	YJL135W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
YJL135W	YJL135W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
YJL135W	YJL135W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
YJL135W	YJL135W	REB1	P21538	810 aa		8.32	□□□□□ -1.08
YJL135W	YJL135W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
YJL135W	YJL135W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
YJL135W	YJL135W	CDC27	P38042	758 aa		8.19	□□□□□ -1.1
YJL135W	YJL135W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	8.19	□□□□□ -1.1
YJL135W	YJL135W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	8.07	□□□□□ -1.12
YJL135W	YJL135W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
YJL135W	YJL135W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
YJL135W	YJL135W	UBP9	P39967	754 aa		7.93	□□□□□ -1.14
YJL135W	YJL135W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
YJL135W	YJL135W	AVT3	P36062	692 aa		7.86	□□□□□ -1.15
YJL135W	YJL135W	TGL3	P40308	642 aa		7.84	□□□□□ -1.15
YJL135W	YJL135W	SPT21	P35209	758 aa		7.82	□□□□□ -1.16
YJL135W	YJL135W	TFC8	Q12308	588 aa		7.8	□□□□□ -1.16
YJL135W	YJL135W	HO	P09932	586 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YJL135W	YJL135W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
YJL135W	YJL135W	SCY1	P53009	804 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YJL135W	YJL135W	DCD1	P06773	312 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YJL135W	YJL135W	BCH2	P36122	765 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YJL135W	YJL135W	MST1	P07236	462 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJL135W	YJL135W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YJL135W	YJL135W	RIM101	P33400	625 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YJL135W	YJL135W	YOR238W	Q08634	303 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJL135W	YJL135W	VNX1	P42839	908 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YJL135W	YJL135W	BDF1	P35817	686 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YJL135W	YJL135W	EPS1	P40557	701 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YJL135W	YJL135W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.23	□□□□□ -1.25	not detected
YJL135W	YJL135W	SPP1	Q03012	353 aa		7.22	□□□□□ -1.25
YJL135W	YJL135W	YJL171C	P46992	396 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YJL135W	YJL135W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
YJL135W	YJL135W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
YJL135W	YJL135W	FKH1	P40466	484 aa		7.14	□□□□□ -1.27
YJL135W	YJL135W	YAP5	P40574	245 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YJL135W	YJL135W	WSC3	Q12215	556 aa		7.09	□□□□□ -1.27
YJL135W	YJL135W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
YJL135W	YJL135W	OXP1	P28273	1286 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	BMT6	Q12291	365 aa		7	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	GTT3	P39996	337 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	PTP3	P40048	928 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	BBC1	P47068	1157 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	LDB19	Q12502	818 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YJL135W	YJL135W	ULI1	P43604	169 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YJL135W	YJL135W	IOC2	Q12072	812 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YJL135W	YJL135W	AI2	P03876	854 aa		6.87	□□□□□ -1.31
YJL135W	YJL135W	RSM7	P47150	247 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YJL135W	YJL135W	MSB4	Q12317	492 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YJL135W	YJL135W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
YJL135W	YJL135W	RTG1	P32607	177 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YJL135W	YJL135W	NCR1	Q12200	1170 aa		6.75	□□□□□ -1.33
YJL135W	YJL135W	PIB1	Q06651	286 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YJL135W	YJL135W	SEC61	P32915	480 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	YOL036W	Q08206	761 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	SET4	P42948	560 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	BCK2	P33306	851 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YJL135W	YJL135W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
YJL135W	YJL135W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YJL135W	YJL135W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YJL135W	YJL135W	MRM1	P25270	412 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YJL135W	YJL135W	SAP30	P38429	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YJL135W	YJL135W	YLR271W	Q06152	274 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YJL135W	YJL135W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.52	□□□□□ -1.37	not detected
YJL135W	YJL135W	JIP4	Q03361	876 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	SAM3	Q08986	587 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	PRE3	P38624	215 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	YDL129W	Q07555	291 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	DAN4	P47179	1161 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YJL135W	YJL135W	XDJ1	P39102	459 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YJL135W	YJL135W	VPS29	P38759	282 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YJL135W	YJL135W	RGA2	Q06407	1009 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YJL135W	YJL135W	YFR006W	P43590	535 aa		6.41	□□□□□ -1.38
YJL135W	YJL135W	STS1	P38637	319 aa		6.39	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	HTA2	P04912	132 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	VRP1	P37370	817 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	PTC4	P38089	393 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	RTG3	P38165	486 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	GYP5	Q12344	894 aa		6.36	□□□□□ -1.39

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