Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 MVP1YMR004W 1536 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YBL012CYBL012C 402 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YCL023CYCL023C 348 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YCL046WYCL046W 324 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 CDC60YPL160W 3273 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 SSQ1YLR369W 1974 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 HDA3YPR179C 1968 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 ARP7YPR034W 1434 nt1.83□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 UBP1YDL122W 2430 nt1.82□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 SWI5YDR146C 2130 nt1.82□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 IST2YBR086C 2841 nt1.82□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 RTT101YJL047C 2529 nt1.82□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 RIM20YOR275C 1986 nt1.81□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YDR048CYDR048C 315 nt1.8□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YAR029WYAR029W 225 nt1.8□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 UBR2YLR024C 5619 nt1.8□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 LYS14YDR034C 2373 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 NAM7YMR080C 2916 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 BRP1YGL007W 378 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YOP1YPR028W 543 nt1.79□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 AGC1YPR021C 2709 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 SWI6YLR182W 2412 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 HTL1YCR020W-B 237 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 snR51snR51 107 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 RFX1YLR176C 2436 nt1.78□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 ZRG17YNR039C 1818 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 NPC2YDL046W 522 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 EMP24YGL200C 612 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.77□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 ATG9YDL149W 2994 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YLR255CYLR255C 354 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 PDR8YLR266C 2106 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 MSC6YOR354C 2079 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 PEP1YBL017C 4740 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 BUD2YKL092C 3315 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 SIR4YDR227W 4077 nt1.76□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 MUK1YPL070W 1839 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 TFC8YPL007C 1767 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 IRC20YLR247C 4671 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 CAT2YML042W 2013 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 HSL1YKL101W 4557 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 HIR3YJR140C 4947 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YDR426CYDR426C 378 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YGL149WYGL149W 306 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YGR265WYGR265W 411 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 PCC1YKR095W-A 267 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 PET309YLR067C 2898 nt1.75□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 DBP6YNR038W 1890 nt1.74□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 CFT2YLR115W 2580 nt1.74□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 MSH5YDL154W 2706 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 LRE1YCL051W 1752 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YIL102CYIL102C 306 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 TRX1YLR043C 312 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 TMA7YLR262C-A 195 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 INP2YMR163C 2118 nt1.73□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YGR250CYGR250C 2346 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 PUT3YKL015W 2940 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YCR022CYCR022C 345 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YJL135WYJL135W 318 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 HSH155YMR288W 2916 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 YLL032CYLL032C 2478 nt1.72□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 LHS1YKL073W 2646 nt1.71□□□□□ -2.13
SSK1Q07084 MGA2YIR033W 3342 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 RTP1YMR185W 2946 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 snR72snR72 98 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YNL144CYNL144C 2223 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 ATG11YPR049C 3537 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 MDM20YOL076W 2391 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 SLY1YDR189W 2001 nt1.71□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 FAB1YFR019W 6837 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 SRP14YDL092W 441 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YDR344CYDR344C 444 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 RPB10YOR210W 213 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YPR063CYPR063C 423 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 VPS15YBR097W 4365 nt1.7□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 MAK10YEL053C 2202 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 ALG13YGL047W 609 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YOR282WYOR282W 321 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 ENV11YGR071C 2583 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 RLM1YPL089C 2031 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 ZIP1YDR285W 2628 nt1.69□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 HER1YOR227W 3741 nt1.68□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 HCS1YKL017C 2052 nt1.68□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 CTR9YOL145C 3234 nt1.68□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YIL032CYIL032C 357 nt1.68□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 BPH1YCR032W 6504 nt1.67□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.67□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 UTP21YLR409C 2820 nt1.67□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 NIP100YPL174C 2607 nt1.67□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 GYP5YPL249C 2685 nt1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms