Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms