Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 SNC1YAL030W 354 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YLR171WYLR171W 390 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 PKR1YMR123W 369 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 TOM22YNL131W 459 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 GRR1YJR090C 3456 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 UTP13YLR222C 2454 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 KAP123YER110C 3342 nt2.14□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPL27BYDR471W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 IRC4YDR540C 540 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YFL019CYFL019C 354 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 BRP1YGL007W 378 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RNR4YGR180C 1038 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPI1YIL119C 1224 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 PEP8YJL053W 1140 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 CMS1YLR003C 876 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 PDR8YLR266C 2106 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 NOP15YNL110C 663 nt2.13□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 DPB11YJL090C 2295 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 CAT2YML042W 2013 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YPS5YGL259W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 TPM2YIL138C 486 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPL40AYIL148W 387 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YKL202WYKL202W 582 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPS22BYLR367W 393 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 PUT3YKL015W 2940 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SEC16YPL085W 6588 nt2.12□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SSQ1YLR369W 1974 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 BRO1YPL084W 2535 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SMB1YER029C 591 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 LSM7YNL147W 348 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPB5YBR154C 648 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 HER1YOR227W 3741 nt2.11□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 MUD2YKL074C 1584 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SPE1YKL184W 1401 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 NOP10YHR072W-A 177 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 AIM29YKR074W 468 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YLR053CYLR053C 327 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YML108WYML108W 318 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPB11YOL005C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YPL197CYPL197C 414 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 snR41snR41 95 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 MGA2YIR033W 3342 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 STH1YIL126W 4080 nt2.1□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SPC72YAL047C 1869 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 MDM32YOR147W 1869 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 MPH1YIR002C 2982 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 ATG11YPR049C 3537 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YGR042WYGR042W 816 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 LCL2YLR104W 396 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RMP1YLR145W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 RPL37AYLR185W 267 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 YCL023CYCL023C 348 nt2.09□□□□□ -2.07
SMF3Q12078 SPP41YDR464W 4308 nt2.09□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 GDS1YOR355W 1569 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YDR286CYDR286C 345 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 RRF1YHR038W 693 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 CCW14YLR390W-A 717 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YML084WYML084W 309 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 RRT1YBL048W 312 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 URA10YMR271C 684 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YNL324WYNL324W 396 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 UFD4YKL010C 4452 nt2.08□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 RPL37BYDR500C 267 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 EMP24YGL200C 612 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 ECL1YGR146C 636 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YJR079WYJR079W 330 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 TEN1YLR010C 483 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 TMA7YLR262C-A 195 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 RPS7BYNL096C 573 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YOR105WYOR105W 327 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 CFT2YLR115W 2580 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 UBP2YOR124C 3819 nt2.07□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 SYH1YPL105C 2550 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 CRM1YGR218W 3255 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YDR341CYDR341C 1824 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 RPA34YJL148W 702 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 MSS18YPR134W 807 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 snR54snR54 86 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 USO1YDL058W 5373 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 YFR016CYFR016C 3702 nt2.05□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 HOP2YGL033W 657 nt2.05□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 SMD1YGR074W 441 nt2.05□□□□□ -2.08
SMF3Q12078 PRM3YPL192C 402 nt2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.6 ms