RNA–Protein interactions for RNA: YAL059C-A

YAL059C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL059C-A, Length 423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL059C-AYAL059C-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YAL059C-AYAL059C-A FAP1P53971 965 aa9.74□□□□□ -0.85
YAL059C-AYAL059C-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YAL059C-AYAL059C-A PRY3P47033 881 aa9.13□□□□□ -0.95
YAL059C-AYAL059C-A AAD16Q02895 342 aa8.86□□□□□ -0.99
YAL059C-AYAL059C-A PRI1P10363 409 aa8.85□□□□□ -0.99
YAL059C-AYAL059C-A ISW2Q08773 1120 aa8.66□□□□□ -1.02
YAL059C-AYAL059C-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YAL059C-AYAL059C-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YAL059C-AYAL059C-A YCK3P39962 524 aa8.46□□□□□ -1.06
YAL059C-AYAL059C-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YAL059C-AYAL059C-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YAL059C-AYAL059C-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YAL059C-AYAL059C-A MRPL32P25348 183 aa8.08□□□□□ -1.12
YAL059C-AYAL059C-A REB1P21538 810 aa7.92□□□□□ -1.14
YAL059C-AYAL059C-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YAL059C-AYAL059C-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YAL059C-AYAL059C-A YGL015CP33199 130 aa7.83□□□□□ -1.16
YAL059C-AYAL059C-A AVT3P36062 692 aa7.82□□□□□ -1.16
YAL059C-AYAL059C-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
YAL059C-AYAL059C-A CDC27P38042 758 aa7.55□□□□□ -1.2
YAL059C-AYAL059C-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YAL059C-AYAL059C-A SPT21P35209 758 aa7.42□□□□□ -1.22
YAL059C-AYAL059C-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
YAL059C-AYAL059C-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YAL059C-AYAL059C-A HOP09932 586 aa7.33□□□□□ -1.24
YAL059C-AYAL059C-A DCD1P06773 312 aa7.31□□□□□ -1.24
YAL059C-AYAL059C-A TFC8Q12308 588 aa7.3□□□□□ -1.24
YAL059C-AYAL059C-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YAL059C-AYAL059C-A SCY1P53009 804 aa7.19□□□□□ -1.26
YAL059C-AYAL059C-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YAL059C-AYAL059C-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YAL059C-AYAL059C-A RIM101P33400 625 aa7.11□□□□□ -1.27
YAL059C-AYAL059C-A TGL3P40308 642 aa7.07□□□□□ -1.28
YAL059C-AYAL059C-A BCH2P36122 765 aa7.06□□□□□ -1.28
YAL059C-AYAL059C-A UBP9P39967 754 aa7.02□□□□□ -1.29
YAL059C-AYAL059C-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YAL059C-AYAL059C-A PTP3P40048 928 aa6.87□□□□□ -1.31
YAL059C-AYAL059C-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YAL059C-AYAL059C-A EPS1P40557 701 aa6.87□□□□□ -1.31
YAL059C-AYAL059C-A OXP1P28273 1286 aa6.85□□□□□ -1.31
YAL059C-AYAL059C-A BDF1P35817 686 aa6.84□□□□□ -1.31
YAL059C-AYAL059C-A BBC1P47068 1157 aa6.75□□□□□ -1.33
YAL059C-AYAL059C-A YOR238WQ08634 303 aa6.73□□□□□ -1.33
YAL059C-AYAL059C-A YBL029C-AQ3E756 94 aa6.71□□□□□ -1.34
YAL059C-AYAL059C-A RSM7P47150 247 aa6.7□□□□□ -1.34
YAL059C-AYAL059C-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YAL059C-AYAL059C-A MST1P07236 462 aa6.69□□□□□ -1.34
YAL059C-AYAL059C-A AI2P03876 854 aa6.67□□□□□ -1.34
YAL059C-AYAL059C-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.63□□□□□ -1.35not detected
YAL059C-AYAL059C-A YAP5P40574 245 aa6.63□□□□□ -1.35
YAL059C-AYAL059C-A VNX1P42839 908 aa6.6□□□□□ -1.35
YAL059C-AYAL059C-A WSC3Q12215 556 aa6.59□□□□□ -1.35
YAL059C-AYAL059C-A SPP1Q03012 353 aa6.58□□□□□ -1.36
YAL059C-AYAL059C-A TFA1P36100 482 aa6.57□□□□□ -1.36
YAL059C-AYAL059C-A GTT3P39996 337 aa6.55□□□□□ -1.36
YAL059C-AYAL059C-A YLR271WQ06152 274 aa6.5□□□□□ -1.37
YAL059C-AYAL059C-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
YAL059C-AYAL059C-A YJL171CP46992 396 aa6.47□□□□□ -1.37
YAL059C-AYAL059C-A PIB1Q06651 286 aa6.44□□□□□ -1.38
YAL059C-AYAL059C-A MRM1P25270 412 aa6.43□□□□□ -1.38
YAL059C-AYAL059C-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YAL059C-AYAL059C-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data6.4□□□□□ -1.38not detected
YAL059C-AYAL059C-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YAL059C-AYAL059C-A FKH1P40466 484 aa6.39□□□□□ -1.39
YAL059C-AYAL059C-A ULI1P43604 169 aa6.39□□□□□ -1.39
YAL059C-AYAL059C-A LDB19Q12502 818 aa6.39□□□□□ -1.39
YAL059C-AYAL059C-A SSP1P38871 571 aa6.37□□□□□ -1.39
YAL059C-AYAL059C-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YAL059C-AYAL059C-A IOC2Q12072 812 aa6.32□□□□□ -1.4
YAL059C-AYAL059C-A MSB4Q12317 492 aa6.32□□□□□ -1.4
YAL059C-AYAL059C-A BMT6Q12291 365 aa6.31□□□□□ -1.4
YAL059C-AYAL059C-A SET4P42948 560 aa6.28□□□□□ -1.4
YAL059C-AYAL059C-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
YAL059C-AYAL059C-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A RTG3P38165 486 aa6.27□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A CST9Q06032 482 aa6.26□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A YOL036WQ08206 761 aa6.26□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A MGA2P40578 1113 aa6.25□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A YFR006WP43590 535 aa6.25□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A RTG1P32607 177 aa6.24□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A VPS29P38759 282 aa6.23□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A NCR1Q12200 1170 aa6.22□□□□□ -1.41
YAL059C-AYAL059C-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YAL059C-AYAL059C-A STS1P38637 319 aa6.18□□□□□ -1.42
YAL059C-AYAL059C-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
YAL059C-AYAL059C-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YAL059C-AYAL059C-A SEC61P32915 480 aa6.17□□□□□ -1.42
YAL059C-AYAL059C-A SAM3Q08986 587 aa6.14□□□□□ -1.43
YAL059C-AYAL059C-A RCR1P38212 213 aa6.13□□□□□ -1.43
YAL059C-AYAL059C-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
YAL059C-AYAL059C-A GYP5Q12344 894 aa6.1□□□□□ -1.43
YAL059C-AYAL059C-A JIP4Q03361 876 aa6.09□□□□□ -1.43
YAL059C-AYAL059C-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
YAL059C-AYAL059C-A HTA2P04912 132 aa6.08□□□□□ -1.44
YAL059C-AYAL059C-A SAP30P38429 201 aa6.08□□□□□ -1.44
YAL059C-AYAL059C-A DCW1P36091 449 aa6.06□□□□□ -1.44
YAL059C-AYAL059C-A DAN4P47179 1161 aa6.04□□□□□ -1.44
YAL059C-AYAL059C-A YDL129WQ07555 291 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms