Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 GIC1YHR061C 945 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RPL37AYLR185W 267 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YLR379WYLR379W 375 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RPS7BYNL096C 573 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 CDC31YOR257W 486 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YPR177CYPR177C 372 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 UBP11YKR098C 2154 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RGL1YPL066W 1440 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 LAG1YHL003C 1236 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YHR210CYHR210C 1026 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 TPM2YIL138C 486 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SHE2YKL130C 741 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RPS17AYML024W 411 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PHO80YOL001W 882 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 TRS20YBR254C 528 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 NIC96YFR002W 2520 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SEY1YOR165W 2331 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 HSL1YKL101W 4557 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 UTP13YLR222C 2454 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 CBF2YGR140W 2871 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 NUP100YKL068W 2880 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 MSH3YCR092C 3057 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RTR2YDR066C 591 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 MET32YDR253C 576 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YGR290WYGR290W 444 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 REV1YOR346W 2958 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SVS1YPL163C 783 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PHR1YOR386W 1698 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 DOT6YER088C 2013 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SPR3YGR059W 1539 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PTC5YOR090C 1719 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SDC1YDR469W 528 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 TIM10YHR005C-A 282 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YIL102CYIL102C 306 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 EAF6YJR082C 342 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 TIM8YJR135W-A 264 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 UTP30YKR060W 825 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 URA10YMR271C 684 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 MGR1YCL044C 1254 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 BRO1YPL084W 2535 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YEL043WYEL043W 2871 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 RGA1YOR127W 3024 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 FMP16YDR070C 282 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 ATP17YDR377W 306 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 BNA7YDR428C 786 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PFD1YJL179W 330 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YKL044WYKL044W 321 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 GPI15YNL038W 690 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YOR105WYOR105W 327 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YPL197CYPL197C 414 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SMB1YER029C 591 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YFR056CYFR056C 369 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SPC1YJR010C-A 285 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 SNC1YAL030W 354 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 YLR458WYLR458W 381 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PKR1YMR123W 369 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 DDR48YMR173W 1293 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 LSM7YNL147W 348 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 Q0017Q0017 162 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 NCL1YBL024W 2055 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 PRK1YIL095W 2433 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS68Q12016 BFA1YJR053W 1725 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 CDC50YCR094W 1176 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YPS5YGL259W 498 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPL40AYIL148W 387 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YKL111CYKL111C 336 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 IRC16YPR038W 360 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 VPH1YOR270C 2523 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MSL5YLR116W 1431 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 VMR1YHL035C 4779 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 TRS130YMR218C 3309 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MZM1YDR493W 372 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPL9AYGL147C 576 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 NOP15YNL110C 663 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 ATX2YOR079C 942 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RGA2YDR379W 3030 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MDM32YOR147W 1869 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 IRA1YBR140C 9279 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 GNT1YOR320C 1476 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 SPC72YAL047C 1869 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 NUP82YJL061W 2142 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 CMS1YLR003C 876 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 VTI1YMR197C 654 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YNL010WYNL010W 726 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPB11YOL005C 363 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MDM20YOL076W 2391 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 VPS15YBR097W 4365 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 SOK2YMR016C 2358 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MPH1YIR002C 2982 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YAP3YHL009C 993 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 NOP10YHR072W-A 177 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPC10YHR143W-A 213 nt1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.5 ms