Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.22■□□□□ 0.83
VPS68Q12016 NSR1YGR159C 1245 nt19.92■□□□□ 0.78
VPS68Q12016 NOP1YDL014W 984 nt19.74■□□□□ 0.75
VPS68Q12016 YKL036CYKL036C 393 nt18.35■□□□□ 0.53
VPS68Q12016 MDJ1YFL016C 1536 nt17.53■□□□□ 0.4
VPS68Q12016 Q0297Q0297 156 nt17.29■□□□□ 0.36
VPS68Q12016 SRX1YKL086W 384 nt17.22■□□□□ 0.35
VPS68Q12016 YJL027CYJL027C 417 nt17.18■□□□□ 0.34
VPS68Q12016 SCS3YGL126W 1143 nt16.77■□□□□ 0.28
VPS68Q12016 YCR051WYCR051W 669 nt16.38■□□□□ 0.21
VPS68Q12016 YOL085CYOL085C 342 nt15.88■□□□□ 0.13
VPS68Q12016 PKP1YIL042C 1185 nt15.64■□□□□ 0.09
VPS68Q12016 DBP2YNL112W 1641 nt15.54■□□□□ 0.08
VPS68Q12016 RPP1BYDL130W 321 nt15.53■□□□□ 0.08
VPS68Q12016 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
VPS68Q12016 CCC1YLR220W 969 nt15.35■□□□□ 0.05
VPS68Q12016 SCJ1YMR214W 1134 nt15.06■□□□□ 0
VPS68Q12016 ATS1YAL020C 1002 nt15.05■□□□□ -0
VPS68Q12016 YBR190WYBR190W 312 nt14.9□□□□□ -0.02
VPS68Q12016 PET122YER153C 765 nt14.82□□□□□ -0.04
VPS68Q12016 SCR1SCR1 522 nt14.74□□□□□ -0.05
VPS68Q12016 RVS167YDR388W 1449 nt14.73□□□□□ -0.05
VPS68Q12016 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.69□□□□□ -0.06
VPS68Q12016 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
VPS68Q12016 RRN5YLR141W 1092 nt14.41□□□□□ -0.1
VPS68Q12016 SHR5YOL110W 714 nt14.22□□□□□ -0.13
VPS68Q12016 YDJ1YNL064C 1230 nt14.21□□□□□ -0.13
VPS68Q12016 RSB1YOR049C 1065 nt14.19□□□□□ -0.14
VPS68Q12016 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.12□□□□□ -0.15
VPS68Q12016 PST2YDR032C 597 nt13.9□□□□□ -0.18
VPS68Q12016 GAR1YHR089C 618 nt13.89□□□□□ -0.19
VPS68Q12016 DEP1YAL013W 1218 nt13.78□□□□□ -0.2
VPS68Q12016 URN1YPR152C 1398 nt13.72□□□□□ -0.21
VPS68Q12016 RPN10YHR200W 807 nt13.59□□□□□ -0.23
VPS68Q12016 YNL208WYNL208W 600 nt13.58□□□□□ -0.24
VPS68Q12016 OPI9YLR338W 858 nt13.48□□□□□ -0.25
VPS68Q12016 YKL097CYKL097C 411 nt13.47□□□□□ -0.25
VPS68Q12016 TIR1YER011W 765 nt13.4□□□□□ -0.26
VPS68Q12016 PUT4YOR348C 1884 nt13.36□□□□□ -0.27
VPS68Q12016 SAH1YER043C 1350 nt13.35□□□□□ -0.27
VPS68Q12016 SHU1YHL006C 453 nt13.3□□□□□ -0.28
VPS68Q12016 ARE1YCR048W 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
VPS68Q12016 SSA1YAL005C 1929 nt13.18□□□□□ -0.3
VPS68Q12016 YJR018WYJR018W 363 nt13.11□□□□□ -0.31
VPS68Q12016 PUN1YLR414C 792 nt13.1□□□□□ -0.31
VPS68Q12016 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.06□□□□□ -0.32
VPS68Q12016 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.05□□□□□ -0.32
VPS68Q12016 POA1YBR022W 534 nt13□□□□□ -0.33
VPS68Q12016 SRB2YHR041C 633 nt12.97□□□□□ -0.33
VPS68Q12016 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
VPS68Q12016 PTC2YER089C 1395 nt12.92□□□□□ -0.34
VPS68Q12016 YJR120WYJR120W 351 nt12.9□□□□□ -0.34
VPS68Q12016 YOR139CYOR139C 393 nt12.86□□□□□ -0.35
VPS68Q12016 WWM1YFL010C 636 nt12.83□□□□□ -0.36
VPS68Q12016 YGR021WYGR021W 873 nt12.83□□□□□ -0.36
VPS68Q12016 BUD23YCR047C 828 nt12.78□□□□□ -0.36
VPS68Q12016 NPL3YDR432W 1245 nt12.77□□□□□ -0.37
VPS68Q12016 HOM6YJR139C 1080 nt12.77□□□□□ -0.37
VPS68Q12016 MNP1YGL068W 585 nt12.74□□□□□ -0.37
VPS68Q12016 NAB2YGL122C 1578 nt12.71□□□□□ -0.37
VPS68Q12016 BSC6YOL137W 1494 nt12.67□□□□□ -0.38
VPS68Q12016 BDH2YAL061W 1254 nt12.66□□□□□ -0.38
VPS68Q12016 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.63□□□□□ -0.39
VPS68Q12016 INM2YDR287W 879 nt12.62□□□□□ -0.39
VPS68Q12016 YOL037CYOL037C 354 nt12.61□□□□□ -0.39
VPS68Q12016 FPR4YLR449W 1179 nt12.6□□□□□ -0.39
VPS68Q12016 RKM5YLR137W 1104 nt12.59□□□□□ -0.39
VPS68Q12016 DAL1YIR027C 1383 nt12.58□□□□□ -0.4
VPS68Q12016 SSA3YBL075C 1950 nt12.54□□□□□ -0.4
VPS68Q12016 FIS1YIL065C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
VPS68Q12016 LSM3YLR438C-A 270 nt12.53□□□□□ -0.4
VPS68Q12016 YBL100CYBL100C 315 nt12.53□□□□□ -0.4
VPS68Q12016 PHO4YFR034C 939 nt12.46□□□□□ -0.41
VPS68Q12016 TRM9YML014W 840 nt12.41□□□□□ -0.42
VPS68Q12016 FUN26YAL022C 1554 nt12.38□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS68Q12016 YLR281CYLR281C 468 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS68Q12016 CCT6YDR188W 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
VPS68Q12016 PUS2YGL063W 1113 nt12.24□□□□□ -0.45
VPS68Q12016 WHI5YOR083W 888 nt12.23□□□□□ -0.45
VPS68Q12016 ALF1YNL148C 765 nt12.2□□□□□ -0.46
VPS68Q12016 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.16□□□□□ -0.46
VPS68Q12016 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.16□□□□□ -0.46
VPS68Q12016 YPS1YLR120C 1710 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS68Q12016 YDR095CYDR095C 411 nt12.1□□□□□ -0.47
VPS68Q12016 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.09□□□□□ -0.47
VPS68Q12016 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.03□□□□□ -0.48
VPS68Q12016 DSK2YMR276W 1122 nt12□□□□□ -0.49
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