Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms