Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA6W5XKT8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA6W5XKT8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPACA6W5XKT8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA6W5XKT8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms