Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R4GMQ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
R4GMQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R4GMQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
R4GMQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R4GMQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R4GMQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R4GMQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R4GMQ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R4GMQ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R4GMQ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R4GMQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GMQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GMQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GMQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GMQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GMQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GMQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GMQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GMQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GMQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R4GMQ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R4GMQ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R4GMQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GMQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GMQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GMQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GMQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GMQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GMQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GMQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GMQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GMQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GMQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GMQ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GMQ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GMQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GMQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GMQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GMQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GMQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GMQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GMQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GMQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GMQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GMQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GMQ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GMQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GMQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GMQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GMQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GMQ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GMQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GMQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GMQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GMQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GMQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GMQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GMQ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GMQ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GMQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GMQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GMQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GMQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GMQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GMQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GMQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GMQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GMQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R4GMQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
R4GMQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R4GMQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R4GMQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R4GMQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R4GMQ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R4GMQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R4GMQ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R4GMQ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R4GMQ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R4GMQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R4GMQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R4GMQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms