Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF2Q9Y5W3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF2Q9Y5W3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF2Q9Y5W3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF2Q9Y5W3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF2Q9Y5W3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms