Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms