Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED3Q9Y3Q3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED3Q9Y3Q3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED3Q9Y3Q3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED3Q9Y3Q3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms