Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM2Q9Y333 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM2Q9Y333 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM2Q9Y333 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM2Q9Y333 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM2Q9Y333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM2Q9Y333 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms