Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NOP58Q9Y2X3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOP58Q9Y2X3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NOP58Q9Y2X3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NOP58Q9Y2X3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms