Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1DQ9Y2S0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1DQ9Y2S0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms