Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP20Q9Y2K6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP20Q9Y2K6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP20Q9Y2K6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
USP20Q9Y2K6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP20Q9Y2K6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms