Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFR2Q9UP52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFR2Q9UP52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFR2Q9UP52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFR2Q9UP52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TFR2Q9UP52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFR2Q9UP52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TFR2Q9UP52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFR2Q9UP52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFR2Q9UP52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms