Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRPF3Q9ULD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRPF3Q9ULD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
BRPF3Q9ULD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRPF3Q9ULD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms