Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKLN1Q9UL63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKLN1Q9UL63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKLN1Q9UL63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKLN1Q9UL63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKLN1Q9UL63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms