Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MKLN1Q9UL63 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKLN1Q9UL63 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
MKLN1Q9UL63 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKLN1Q9UL63 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKLN1Q9UL63 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKLN1Q9UL63 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKLN1Q9UL63 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKLN1Q9UL63 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKLN1Q9UL63 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKLN1Q9UL63 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKLN1Q9UL63 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKLN1Q9UL63 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKLN1Q9UL63 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKLN1Q9UL63 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKLN1Q9UL63 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKLN1Q9UL63 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKLN1Q9UL63 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKLN1Q9UL63 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKLN1Q9UL63 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKLN1Q9UL63 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKLN1Q9UL63 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKLN1Q9UL63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKLN1Q9UL63 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKLN1Q9UL63 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKLN1Q9UL63 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKLN1Q9UL63 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKLN1Q9UL63 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKLN1Q9UL63 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKLN1Q9UL63 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKLN1Q9UL63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKLN1Q9UL63 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKLN1Q9UL63 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKLN1Q9UL63 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKLN1Q9UL63 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKLN1Q9UL63 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKLN1Q9UL63 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKLN1Q9UL63 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKLN1Q9UL63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKLN1Q9UL63 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKLN1Q9UL63 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKLN1Q9UL63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MKLN1Q9UL63 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKLN1Q9UL63 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKLN1Q9UL63 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKLN1Q9UL63 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKLN1Q9UL63 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKLN1Q9UL63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKLN1Q9UL63 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKLN1Q9UL63 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKLN1Q9UL63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKLN1Q9UL63 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKLN1Q9UL63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKLN1Q9UL63 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKLN1Q9UL63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKLN1Q9UL63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MKLN1Q9UL63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKLN1Q9UL63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKLN1Q9UL63 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKLN1Q9UL63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKLN1Q9UL63 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKLN1Q9UL63 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKLN1Q9UL63 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKLN1Q9UL63 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKLN1Q9UL63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKLN1Q9UL63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKLN1Q9UL63 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKLN1Q9UL63 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKLN1Q9UL63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKLN1Q9UL63 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKLN1Q9UL63 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKLN1Q9UL63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MKLN1Q9UL63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKLN1Q9UL63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKLN1Q9UL63 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKLN1Q9UL63 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKLN1Q9UL63 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKLN1Q9UL63 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKLN1Q9UL63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKLN1Q9UL63 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKLN1Q9UL63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKLN1Q9UL63 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKLN1Q9UL63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKLN1Q9UL63 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MKLN1Q9UL63 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKLN1Q9UL63 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKLN1Q9UL63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKLN1Q9UL63 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKLN1Q9UL63 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKLN1Q9UL63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKLN1Q9UL63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKLN1Q9UL63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKLN1Q9UL63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKLN1Q9UL63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms