Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDV3Q9UKY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDV3Q9UKY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDV3Q9UKY7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CDV3Q9UKY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDV3Q9UKY7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDV3Q9UKY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms