Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA11Q9UKX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA11Q9UKX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA11Q9UKX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA11Q9UKX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA11Q9UKX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA11Q9UKX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA11Q9UKX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA11Q9UKX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA11Q9UKX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494.5 ms