Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2D1Q9UJQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2D1Q9UJQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2D1Q9UJQ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms